Высокопроизводительное вычислительное решение для картографирования считываемых данных до эталонной и de novo сборки данных секвенирования следующего поколения. Чтение карт данных секвенирования Illumina, Pacific Biosciences, Ion Torrent, SOLiD и 454 De novo сборка данных Illumina, Pacific Biosciences, Ион Торрент и 454 секвенирования Поддержка как короткого чтения, так и длительного чтения сборки и картирования С помощью интерфейса командной строки ячейки CLC Assembly Cell вы можете легко включить эти функции в сценарии и другие рабочие процессы следующего поколения, связанные с последовательностью. Его легко установить на настольный компьютер или более крупный вычислительный кластер. Подробная информация о продукте Производительность Сравнительный анализ Последняя версия CLC Assembly Cell представляет инструменты для исправления ошибок и de novo сборки сырых чтений PacBio. Высококачественные сборки могут быть сгенерированы за долю времени, необходимого ведущим альтернативам. Сборочная ячейка CLC потребляет менее 10 процентов памяти, используемой альтернативными решениями, при этом сборка выполняется быстрее. Мы сравнили производительность промышленного стандарта HGAP1 при работе на высокопроизводительном компьютере с производительностью рабочего процесса сборки De Novo Assembly в ячейке CLC Assembly Cell. Пожалуйста, обратите внимание, что наш конвейер De Novo Assembly был запущен на стандартном ноутбуке для такого сравнения. Заявления Сборочная ячейка CLC ускоряется за счет реализации продвинутых алгоритмов: они используют набор инструкций SIMD для распараллеливания и ускорения вычислений интенсивных участков алгоритмов, а также делают программное обеспечение одним из самых быстрых и точных пакетов для анализа данных NGS на рынке.